000			05908nab|a22004937a|4500
001			65776
003			MX-TxCIM
005			20230731172212.0
008			20221s2022||||mx |||p|op||||00||0|English, Spanish|d
022			_a0187-7380
024	8		_ahttps://doi.org/10.35196/rfm.2022.3.293
040			_aMX-TxCIM
041			_aeng
100	1		_aHernández-Rodríguez, M. _929394
245	1	0	_aDesarrollo de marcadores para mejoramiento de maíz con proteína de calidad y estudio de interacción entre los genes Opaco-2 y Ask2
246			_aMarker development for quality protein maize breeding and an interaction study between Opaque-2 and Ask2 genes
260			_bSociedad Mexicana de Fitogenetica, _c2022. _aMexico :
500			_aPeer review
500			_aOpen Access
500			_aTitle and abstract available in English
520			_aLos granos de maíz de alta calidad proteica (QPM) contienen el doble de lisina y triptófano en comparación con los granos de maíz normales. Aunque la mutación opaco-2 (o2) es la causa subyacente de este cambio beneficioso, otros genes como la aspartato quinasa-2 (Ask2) afectan en menor grado el contenido de aminoácidos en el endospermo. Hasta el momento, los informes sobre la interacción entre ambos loci son escasos y no existen ensayos de alto rendimiento para la identificación de los alelos de estos genes. Los objetivos de esta investigación fueron: 1) estudiar la interacción entre los genes o2 y Ask2 con respecto a la acumulación de aminoácidos en el endospermo de una población F2, 2) identificar SNPs conservados en el gen o2 que puedan ser utilizados como marcadores, 3) estimar la frecuencia de un SNP de Ask2, asociado con la acumulación de lisina en el endospermo, en germoplasma del CIMMYT, y 4) desarrollar ensayos de marcadores de alto rendimiento para estos SNPs. El estudio de interacción mostró un efecto preponderante del o2 sobre la acumulación de 11 aminoácidos (P ≤ 0.01). Al parecer, Ask2 solamente actúa con o2 para mejorar marginalmente los niveles de lisina, histidina y metionina en los homocigotos recesivos dobles. La secuenciación de amplicones en el locus o2 condujo a la identificación de un SNP en el exón 1 que discriminó todos los genotipos QPM (C) de los genotipos no QPM (T). La validación de este SNP a través de los ensayos KASP™ indicó que fue 92 % asertivo en la diferenciación de los genotipos o2. En contraste, la frecuencia del SNP de Ask2 en el germoplasma QPM del CIMMYT fue baja; sin embargo, un marcador SSCP desarrollado utilizando este SNP detectó cinco variantes, lo que indica que otros cambios de base desconocidos pueden conferir respuestas positivas de aumento de lisina. Estos marcadores podrían ayudar a la selección asistida en variedades QPM.
520			_aQuality Protein Maize (QPM) kernels contain twice the amounts of lysine and tryptophan compared to normal corn kernels. Although the opaque-2 (o2) mutation is the underlying cause of this beneficial change, other genes such as Aspartate kinase-2 (Ask2) affect the amino acid content in the endosperm to a lesser degree. To date, reports on the interaction between both loci are scarce and there are no high-throughput assays for the identification of the alleles of these genes. The objectives of this research were: 1) to study the interaction between the o2 and Ask2 genes with respect to the accumulation of amino acids in the endosperm in an F2 population, 2) to identify conserved SNPs into the o2 gene that can be used as markers, 3) to estimate the frequency of an SNP of Ask2 associated with the accumulation of lysine in the endosperm in CIMMYT germplasm, and 4) to develop high-throughput marker assays for these SNPs. The interaction study showed a preponderant effect of o2 on the accumulation of 11 amino acids (P ≤ 0.01). Ask2 appeared only to act with o2 to enhance marginally lysine, histidine and methionine levels in the double recessive homozygotes. Sequencing of amplicons at the o2 locus led to the identification of an SNP in exon 1 that discriminated all QPM (C) genotypes from non-QPM (T) genotypes. Validation of this SNP through KASP™ assays indicated that it was 92 % assertive in differentiating the o2 genotypes. In contrast, the frequency of the Ask2 SNP in CIMMYT QPM germplasm was low; however, an SSCP marker developed using this SNP detected five variants indicating that other unknown base changes may confer positive lysine-increasing responses. These markers could aid the marker-assisted selection of QPM cultivars.
546			_aText in Spanish
591			_aSkinner, D.J. : Not in IRS staff list but CIMMYT Affiliation
650		7	_2AGROVOC _91314 _aZea mays
650		7	_2AGROVOC _910737 _aMarker-assisted selection
650		0	_aSingle nucleotide polymorphisms _gAGROVOC _910805
650		7	_2AGROVOC _91223 _aProtein quality
700	1		_aBABU, R. _8INT2925 _9875 _gGlobal Maize Program
700	1		_aSkinner, D.J. _920433
700	1		_aPalacios-Rojas, N. _8INT2691 _9850 _gGlobal Maize Program
700	1		_aMartins, M.C.M. _929395
700	1		_aGarcía Zavala, J.J. _95363
700	1		_aLobato-Ortiz, R. _98576
700	1		_aSantacruz-Varela, A. _9682
700	1		_aCastillo-González, F. _921790
700	1		_aYunbi Xu _8INT2735 _9857 _gGlobal Maize Program
700	1		_aPrasanna, B.M. _8INT3057 _9887 _gGlobal Maize Program
773	0		_tRevista Fitotecnia Mexicana _gv. 45, no. 3, p. 293-302 _dMexico : Sociedad Mexicana de Fitogenetica, 2022 _x0187-7380 _wG444640
856			_yOpen Access through DSpace _uhttps://hdl.handle.net/10883/22281
942			_cJA _n0 _2ddc
999			_c65776 _d65768